目前，我市共有中小学(含职教、特教)102所，其中小学57所，初中33所，普通高中9所，职业高中2所，特教学校1所，在校中小学生113764人，在职教职工7601人。另有幼儿园62所，在园幼儿18181人。
多年来，在上级有关部门的领导下，我市教育工作年年攀升新高度，不断实现新跨越，取得了令人瞩目的成绩：
一是以国际奥赛为代表的学科竞赛屡屡摘金夺银。目前我市共获得13块金牌和2块银牌。
二是以科技小发明为代表的创新教育饮誉大江南北。全市学生小发明作品共有5件获国际奖、147件获国家级奖、305件获省级奖，113件作品申请国家专利;5名学生被授予“中国当代发明家”称号，2名学生获“中国少年科学院院士”称号。
三是以体艺教育为代表的素质教育奇葩芬芳。我市先后为国家田径队、解放军运动队输送优秀运动员10多名。他们中有国家女排主力邱爱华、国家男排队长施海荣、亚运会击剑冠军陈锋、亚运会女子佩剑金牌得主包盈盈。
四是以德育、环保教育为代表的特色教育硕果累累。东南中学充分挖掘历史资源，成为“江苏省爱国主义教育基地”。在国家级绿色学校汇龙中学的带动下，全市共有15所学校创建成南通市级以上绿色学校。江海中学的感恩教育、紫薇小学的阳光少年评比、长江小学的小公民道德教育等都声名远扬。
五是基础教育质量保持高位走强态势。1987年我市被省政府命名为“基础教育先进县”，1997年被江苏省人民政府授予“教育先进县”称号，2003年，荣获江苏省“两基”工作先进县(市)称号。启东教育已成为我市精神文明建设的窗口和对外展示形象的靓丽名片。
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